Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrpfP62307 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrpfP62307 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SnrpfP62307 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnrpfP62307 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms