Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP1S1P61966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP1S1P61966 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1S1P61966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms