Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdk5r1P61809 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk5r1P61809 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk5r1P61809 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms