Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smg6P61406 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Smg6P61406 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smg6P61406 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Smg6P61406 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smg6P61406 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms