Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snap25P60879 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snap25P60879 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snap25P60879 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snap25P60879 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms