Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nphp4P59240 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nphp4P59240 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nphp4P59240 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nphp4P59240 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms