Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtnsP57757 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtnsP57757 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtnsP57757 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms