Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bace1P56818 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bace1P56818 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bace1P56818 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bace1P56818 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bace1P56818 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bace1P56818 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bace1P56818 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bace1P56818 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms