Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP7P55210 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASP7P55210 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASP7P55210 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASP7P55210 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASP7P55210 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP7P55210 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP7P55210 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASP7P55210 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CASP7P55210 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CASP7P55210 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASP7P55210 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP7P55210 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP7P55210 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP7P55210 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP7P55210 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASP7P55210 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASP7P55210 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CASP7P55210 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP7P55210 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP7P55210 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP7P55210 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASP7P55210 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CASP7P55210 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASP7P55210 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP7P55210 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP7P55210 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP7P55210 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP7P55210 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASP7P55210 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASP7P55210 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP7P55210 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASP7P55210 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASP7P55210 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP7P55210 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP7P55210 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP7P55210 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASP7P55210 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms