Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMP3P54852 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMP3P54852 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMP3P54852 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMP3P54852 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMP3P54852 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMP3P54852 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMP3P54852 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMP3P54852 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMP3P54852 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMP3P54852 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMP3P54852 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMP3P54852 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMP3P54852 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMP3P54852 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMP3P54852 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMP3P54852 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.5 ms