Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NrlP54846 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NrlP54846 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NrlP54846 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NrlP54846 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrlP54846 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrlP54846 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NrlP54846 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NrlP54846 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NrlP54846 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NrlP54846 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrlP54846 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NrlP54846 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NrlP54846 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrlP54846 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrlP54846 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NrlP54846 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrlP54846 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NrlP54846 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrlP54846 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrlP54846 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrlP54846 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrlP54846 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NrlP54846 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrlP54846 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrlP54846 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrlP54846 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NrlP54846 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrlP54846 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrlP54846 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrlP54846 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NrlP54846 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NrlP54846 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrlP54846 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NrlP54846 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NrlP54846 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NrlP54846 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NrlP54846 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms