Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC24CP53992 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24CP53992 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms