Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB1P53618 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB1P53618 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB1P53618 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB1P53618 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB1P53618 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
COPB1P53618 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB1P53618 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB1P53618 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB1P53618 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB1P53618 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB1P53618 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPB1P53618 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB1P53618 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB1P53618 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB1P53618 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB1P53618 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms