Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFCP49767 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFCP49767 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms