Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPAP49450 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPAP49450 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CENPAP49450 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPAP49450 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPAP49450 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPAP49450 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPAP49450 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPAP49450 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPAP49450 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPAP49450 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPAP49450 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPAP49450 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPAP49450 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CENPAP49450 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPAP49450 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPAP49450 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPAP49450 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPAP49450 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPAP49450 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPAP49450 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPAP49450 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms