Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ercc3P49135 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ercc3P49135 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc3P49135 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc3P49135 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms