Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC10P48553 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAPPC10P48553 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC10P48553 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms