Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nedd4P46935 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nedd4P46935 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd4P46935 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd4P46935 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms