Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NodalP43021 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NodalP43021 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NodalP43021 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NodalP43021 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NodalP43021 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NodalP43021 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NodalP43021 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NodalP43021 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NodalP43021 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NodalP43021 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NodalP43021 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NodalP43021 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NodalP43021 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NodalP43021 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NodalP43021 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NodalP43021 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms