Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTHFRP42898 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTHFRP42898 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTHFRP42898 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms