Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN2BP42772 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKN2BP42772 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2BP42772 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms