Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIA3P42263 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA3P42263 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA3P42263 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms