Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TfamP40630 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TfamP40630 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TfamP40630 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TfamP40630 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TfamP40630 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TfamP40630 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TfamP40630 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TfamP40630 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TfamP40630 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TfamP40630 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TfamP40630 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TfamP40630 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TfamP40630 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TfamP40630 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TfamP40630 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.2 ms