Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab21P35282 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab21P35282 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab21P35282 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab21P35282 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab21P35282 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms