Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPA3P35244 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA3P35244 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA3P35244 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA3P35244 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPA3P35244 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPA3P35244 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPA3P35244 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA3P35244 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA3P35244 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA3P35244 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA3P35244 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPA3P35244 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPA3P35244 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA3P35244 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA3P35244 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA3P35244 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPA3P35244 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPA3P35244 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPA3P35244 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPA3P35244 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPA3P35244 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RPA3P35244 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPA3P35244 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPA3P35244 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPA3P35244 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms