Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sftpa1P35242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sftpa1P35242 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sftpa1P35242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms