Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPN7P35236 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN7P35236 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN7P35236 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms