Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA6P31267 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA6P31267 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA6P31267 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms