Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC7A1P30825 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms