Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCAP28676 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCAP28676 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCAP28676 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCAP28676 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCAP28676 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCAP28676 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCAP28676 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCAP28676 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCAP28676 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCAP28676 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCAP28676 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCAP28676 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCAP28676 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCAP28676 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCAP28676 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCAP28676 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCAP28676 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCAP28676 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCAP28676 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCAP28676 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCAP28676 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCAP28676 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCAP28676 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCAP28676 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCAP28676 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCAP28676 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms