Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IppP28575 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IppP28575 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IppP28575 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IppP28575 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IppP28575 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IppP28575 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IppP28575 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IppP28575 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IppP28575 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IppP28575 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IppP28575 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IppP28575 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IppP28575 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IppP28575 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IppP28575 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IppP28575 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IppP28575 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IppP28575 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IppP28575 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IppP28575 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IppP28575 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IppP28575 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IppP28575 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IppP28575 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IppP28575 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms