Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB5P28074 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMB5P28074 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms