Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2afxP27661 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2afxP27661 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2afxP27661 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms