Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SarsP26638 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarsP26638 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarsP26638 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarsP26638 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SarsP26638 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarsP26638 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarsP26638 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SarsP26638 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SarsP26638 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarsP26638 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarsP26638 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarsP26638 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarsP26638 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarsP26638 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarsP26638 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarsP26638 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarsP26638 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarsP26638 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarsP26638 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarsP26638 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarsP26638 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarsP26638 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SarsP26638 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SarsP26638 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarsP26638 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarsP26638 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarsP26638 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarsP26638 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SarsP26638 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms