Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gria1P23818 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gria1P23818 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gria1P23818 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms