Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Xrcc6P23475 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Xrcc6P23475 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Xrcc6P23475 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms