Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P22392 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P22392 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME2P22392 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME2P22392 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME2P22392 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME2P22392 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME2P22392 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME2P22392 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME2P22392 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME2P22392 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME2P22392 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME2P22392 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME2P22392 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME2P22392 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME2P22392 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME2P22392 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME2P22392 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME2P22392 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NME2P22392 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME2P22392 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME2P22392 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NME2P22392 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME2P22392 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NME2P22392 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms