Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS4Y1P22090 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS4Y1P22090 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS4Y1P22090 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms