Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGAM1P18669 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM1P18669 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM1P18669 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms