Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtpraP18052 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpraP18052 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpraP18052 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpraP18052 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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