Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hmga1P17095 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hmga1P17095 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hmga1P17095 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms