Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabra6P16305 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gabra6P16305 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms