Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTHFD2P13995 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFD2P13995 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFD2P13995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms