Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCG2P13521 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCG2P13521 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCG2P13521 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCG2P13521 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCG2P13521 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCG2P13521 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCG2P13521 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCG2P13521 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCG2P13521 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCG2P13521 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCG2P13521 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCG2P13521 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCG2P13521 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCG2P13521 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG2P13521 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG2P13521 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG2P13521 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCG2P13521 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCG2P13521 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG2P13521 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG2P13521 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG2P13521 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG2P13521 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCG2P13521 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG2P13521 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG2P13521 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG2P13521 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCG2P13521 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCG2P13521 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCG2P13521 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCG2P13521 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCG2P13521 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCG2P13521 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG2P13521 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG2P13521 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCG2P13521 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCG2P13521 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCG2P13521 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCG2P13521 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCG2P13521 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG2P13521 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG2P13521 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCG2P13521 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCG2P13521 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG2P13521 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG2P13521 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG2P13521 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCG2P13521 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCG2P13521 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG2P13521 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG2P13521 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCG2P13521 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG2P13521 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG2P13521 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCG2P13521 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCG2P13521 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SCG2P13521 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCG2P13521 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms