Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM1P13164 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms