Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrm1P12657 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chrm1P12657 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrm1P12657 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 414.4 ms