Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb2P11835 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb2P11835 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms