Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DMDP11532 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DMDP11532 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DMDP11532 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DMDP11532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DMDP11532 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DMDP11532 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DMDP11532 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DMDP11532 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DMDP11532 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DMDP11532 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DMDP11532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DMDP11532 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DMDP11532 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DMDP11532 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DMDP11532 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DMDP11532 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DMDP11532 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DMDP11532 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DMDP11532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DMDP11532 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DMDP11532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DMDP11532 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DMDP11532 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DMDP11532 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DMDP11532 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DMDP11532 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DMDP11532 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DMDP11532 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DMDP11532 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DMDP11532 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DMDP11532 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DMDP11532 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DMDP11532 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DMDP11532 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DMDP11532 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DMDP11532 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DMDP11532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DMDP11532 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DMDP11532 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DMDP11532 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DMDP11532 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DMDP11532 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DMDP11532 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DMDP11532 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DMDP11532 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DMDP11532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DMDP11532 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DMDP11532 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DMDP11532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DMDP11532 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DMDP11532 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DMDP11532 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms