Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Tnp1P10856 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms