Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARBP10826 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARBP10826 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARBP10826 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RARBP10826 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RARBP10826 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARBP10826 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARBP10826 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARBP10826 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARBP10826 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARBP10826 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARBP10826 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARBP10826 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARBP10826 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RARBP10826 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RARBP10826 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RARBP10826 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RARBP10826 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARBP10826 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARBP10826 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RARBP10826 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARBP10826 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARBP10826 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARBP10826 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARBP10826 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RARBP10826 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RARBP10826 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RARBP10826 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARBP10826 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RARBP10826 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARBP10826 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARBP10826 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RARBP10826 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARBP10826 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RARBP10826 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RARBP10826 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RARBP10826 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RARBP10826 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms